孕酮水平下降的原因包括以下几个方面：

1. 生理性原因：孕酮主要通过卵巢的黄体细胞分泌。在排卵期，卵巢不分泌孕酮，因此孕酮水平会相应降低。这种情况属于生理性降低，一般在排卵后，孕酮水平会逐渐升高。

2. 内分泌系统疾病：常见的甲状腺功能异常和肾上腺分泌功能异常都可以影响卵巢功能，导致黄体分泌孕酮减少。

3. 黄体功能不全：黄体发育不全会导致分泌孕酮不足，从而出现孕酮降低的症状。临床上，习惯性流产、不孕等患者常常出现孕酮水平下降的情况。

4. 胚胎发育异常：孕酮水平下降可能与胚胎本身发育异常有关。例如，胎儿染色体异常或胚胎通过母体感染病毒等情况都可能导致孕酮水平下降。

当发现孕酮水平下降时，应及时到医院就诊治疗，以免延误病情。